Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sstr1P30873 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sstr1P30873 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Sstr1P30873 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms