Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cbx2P30658 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cbx2P30658 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms