Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PrkcdP28867 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkcdP28867 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkcdP28867 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkcdP28867 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkcdP28867 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkcdP28867 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkcdP28867 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkcdP28867 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkcdP28867 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkcdP28867 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkcdP28867 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkcdP28867 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkcdP28867 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkcdP28867 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkcdP28867 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkcdP28867 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkcdP28867 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkcdP28867 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkcdP28867 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkcdP28867 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms