Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp3P28862 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp3P28862 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp3P28862 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms