Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RxraP28700 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RxraP28700 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RxraP28700 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RxraP28700 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RxraP28700 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RxraP28700 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RxraP28700 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RxraP28700 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RxraP28700 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RxraP28700 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RxraP28700 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RxraP28700 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RxraP28700 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RxraP28700 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RxraP28700 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RxraP28700 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RxraP28700 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RxraP28700 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RxraP28700 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RxraP28700 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RxraP28700 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RxraP28700 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RxraP28700 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RxraP28700 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RxraP28700 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RxraP28700 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RxraP28700 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RxraP28700 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RxraP28700 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RxraP28700 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RxraP28700 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RxraP28700 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RxraP28700 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RxraP28700 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RxraP28700 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RxraP28700 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RxraP28700 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RxraP28700 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RxraP28700 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RxraP28700 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RxraP28700 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RxraP28700 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RxraP28700 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RxraP28700 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RxraP28700 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RxraP28700 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RxraP28700 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RxraP28700 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RxraP28700 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RxraP28700 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RxraP28700 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RxraP28700 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RxraP28700 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RxraP28700 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RxraP28700 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RxraP28700 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RxraP28700 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RxraP28700 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RxraP28700 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RxraP28700 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RxraP28700 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RxraP28700 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RxraP28700 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RxraP28700 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RxraP28700 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RxraP28700 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RxraP28700 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RxraP28700 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RxraP28700 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RxraP28700 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RxraP28700 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RxraP28700 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RxraP28700 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RxraP28700 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RxraP28700 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RxraP28700 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RxraP28700 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RxraP28700 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RxraP28700 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RxraP28700 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RxraP28700 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RxraP28700 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RxraP28700 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RxraP28700 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RxraP28700 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RxraP28700 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RxraP28700 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RxraP28700 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RxraP28700 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RxraP28700 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RxraP28700 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RxraP28700 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RxraP28700 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RxraP28700 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RxraP28700 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RxraP28700 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RxraP28700 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RxraP28700 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RxraP28700 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms