Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LoxP28301 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LoxP28301 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LoxP28301 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LoxP28301 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LoxP28301 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LoxP28301 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LoxP28301 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LoxP28301 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LoxP28301 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LoxP28301 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LoxP28301 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LoxP28301 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LoxP28301 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LoxP28301 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LoxP28301 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LoxP28301 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LoxP28301 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LoxP28301 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LoxP28301 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LoxP28301 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LoxP28301 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LoxP28301 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LoxP28301 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LoxP28301 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LoxP28301 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LoxP28301 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LoxP28301 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LoxP28301 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LoxP28301 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LoxP28301 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LoxP28301 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LoxP28301 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LoxP28301 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LoxP28301 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LoxP28301 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LoxP28301 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LoxP28301 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LoxP28301 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LoxP28301 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LoxP28301 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LoxP28301 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LoxP28301 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LoxP28301 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LoxP28301 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LoxP28301 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LoxP28301 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LoxP28301 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LoxP28301 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LoxP28301 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LoxP28301 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LoxP28301 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LoxP28301 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LoxP28301 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LoxP28301 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LoxP28301 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LoxP28301 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LoxP28301 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LoxP28301 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LoxP28301 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LoxP28301 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LoxP28301 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LoxP28301 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LoxP28301 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LoxP28301 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LoxP28301 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LoxP28301 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LoxP28301 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LoxP28301 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LoxP28301 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LoxP28301 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LoxP28301 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LoxP28301 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LoxP28301 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LoxP28301 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LoxP28301 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LoxP28301 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LoxP28301 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LoxP28301 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LoxP28301 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LoxP28301 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LoxP28301 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LoxP28301 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LoxP28301 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LoxP28301 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LoxP28301 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LoxP28301 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LoxP28301 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LoxP28301 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LoxP28301 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LoxP28301 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LoxP28301 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LoxP28301 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LoxP28301 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LoxP28301 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LoxP28301 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LoxP28301 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LoxP28301 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LoxP28301 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LoxP28301 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms