Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja4P28235 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja4P28235 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja4P28235 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gja4P28235 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gja4P28235 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja4P28235 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja4P28235 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja4P28235 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gja4P28235 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gja4P28235 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gja4P28235 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja4P28235 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja4P28235 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gja4P28235 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gja4P28235 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gja4P28235 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja4P28235 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja4P28235 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja4P28235 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja4P28235 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja4P28235 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja4P28235 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja4P28235 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja4P28235 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja4P28235 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja4P28235 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja4P28235 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja4P28235 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja4P28235 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gja4P28235 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja4P28235 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja4P28235 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gja4P28235 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gja4P28235 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja4P28235 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja4P28235 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja4P28235 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gja4P28235 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja4P28235 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja4P28235 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja4P28235 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja4P28235 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms