Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjc1P28229 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjc1P28229 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjc1P28229 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjc1P28229 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjc1P28229 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjc1P28229 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjc1P28229 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjc1P28229 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjc1P28229 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjc1P28229 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjc1P28229 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjc1P28229 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjc1P28229 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjc1P28229 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjc1P28229 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms