Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CenpbP27790 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CenpbP27790 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CenpbP27790 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CenpbP27790 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CenpbP27790 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CenpbP27790 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CenpbP27790 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms