Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CftrP26361 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CftrP26361 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CftrP26361 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CftrP26361 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CftrP26361 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CftrP26361 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CftrP26361 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CftrP26361 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CftrP26361 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CftrP26361 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CftrP26361 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CftrP26361 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CftrP26361 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CftrP26361 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CftrP26361 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CftrP26361 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CftrP26361 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CftrP26361 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CftrP26361 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CftrP26361 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CftrP26361 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CftrP26361 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CftrP26361 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CftrP26361 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CftrP26361 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CftrP26361 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CftrP26361 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CftrP26361 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CftrP26361 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CftrP26361 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
CftrP26361 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CftrP26361 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CftrP26361 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CftrP26361 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CftrP26361 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CftrP26361 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CftrP26361 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CftrP26361 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CftrP26361 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CftrP26361 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CftrP26361 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CftrP26361 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CftrP26361 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CftrP26361 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CftrP26361 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CftrP26361 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CftrP26361 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CftrP26361 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CftrP26361 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CftrP26361 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CftrP26361 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CftrP26361 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CftrP26361 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CftrP26361 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CftrP26361 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CftrP26361 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CftrP26361 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
CftrP26361 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
CftrP26361 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CftrP26361 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CftrP26361 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CftrP26361 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CftrP26361 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CftrP26361 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CftrP26361 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CftrP26361 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CftrP26361 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CftrP26361 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CftrP26361 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
CftrP26361 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
CftrP26361 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CftrP26361 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CftrP26361 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CftrP26361 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CftrP26361 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CftrP26361 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CftrP26361 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CftrP26361 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
CftrP26361 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CftrP26361 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CftrP26361 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CftrP26361 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CftrP26361 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CftrP26361 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
CftrP26361 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CftrP26361 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CftrP26361 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CftrP26361 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CftrP26361 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CftrP26361 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CftrP26361 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CftrP26361 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CftrP26361 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CftrP26361 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CftrP26361 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CftrP26361 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CftrP26361 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CftrP26361 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CftrP26361 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms