Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmo2P25801 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmo2P25801 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms