Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxd11P23813 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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