Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkchP23298 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkchP23298 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkchP23298 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkchP23298 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkchP23298 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkchP23298 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkchP23298 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkchP23298 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkchP23298 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkchP23298 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkchP23298 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PrkchP23298 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PrkchP23298 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkchP23298 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkchP23298 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkchP23298 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkchP23298 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkchP23298 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkchP23298 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkchP23298 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkchP23298 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrkchP23298 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrkchP23298 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms