Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja1P23242 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gja1P23242 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja1P23242 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja1P23242 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja1P23242 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja1P23242 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja1P23242 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja1P23242 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja1P23242 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja1P23242 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja1P23242 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja1P23242 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja1P23242 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja1P23242 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja1P23242 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms