Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ntf3P20181 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ntf3P20181 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms