Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnc1P19123 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tnnc1P19123 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnnc1P19123 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnc1P19123 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms