Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ass1P16460 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ass1P16460 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ass1P16460 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ass1P16460 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ass1P16460 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ass1P16460 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ass1P16460 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ass1P16460 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ass1P16460 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms