Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CnpP16330 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CnpP16330 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CnpP16330 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CnpP16330 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CnpP16330 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CnpP16330 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CnpP16330 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CnpP16330 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CnpP16330 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CnpP16330 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CnpP16330 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CnpP16330 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CnpP16330 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CnpP16330 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CnpP16330 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CnpP16330 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CnpP16330 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CnpP16330 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CnpP16330 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CnpP16330 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CnpP16330 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CnpP16330 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CnpP16330 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CnpP16330 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CnpP16330 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CnpP16330 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CnpP16330 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CnpP16330 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CnpP16330 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CnpP16330 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CnpP16330 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CnpP16330 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CnpP16330 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CnpP16330 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CnpP16330 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CnpP16330 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CnpP16330 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CnpP16330 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CnpP16330 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CnpP16330 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CnpP16330 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CnpP16330 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CnpP16330 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CnpP16330 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CnpP16330 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CnpP16330 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CnpP16330 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CnpP16330 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CnpP16330 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CnpP16330 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CnpP16330 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CnpP16330 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CnpP16330 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CnpP16330 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CnpP16330 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CnpP16330 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CnpP16330 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CnpP16330 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CnpP16330 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CnpP16330 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CnpP16330 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CnpP16330 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CnpP16330 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CnpP16330 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CnpP16330 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CnpP16330 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CnpP16330 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CnpP16330 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CnpP16330 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CnpP16330 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CnpP16330 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CnpP16330 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CnpP16330 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CnpP16330 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CnpP16330 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CnpP16330 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CnpP16330 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CnpP16330 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CnpP16330 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CnpP16330 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CnpP16330 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CnpP16330 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CnpP16330 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CnpP16330 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CnpP16330 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CnpP16330 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CnpP16330 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CnpP16330 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CnpP16330 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CnpP16330 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CnpP16330 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CnpP16330 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CnpP16330 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CnpP16330 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CnpP16330 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CnpP16330 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CnpP16330 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CnpP16330 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CnpP16330 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms