Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkceP16054 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkceP16054 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkceP16054 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkceP16054 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrkceP16054 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkceP16054 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkceP16054 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkceP16054 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkceP16054 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkceP16054 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkceP16054 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkceP16054 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkceP16054 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkceP16054 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms