Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp53P15975 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp53P15975 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp53P15975 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp53P15975 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp53P15975 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp53P15975 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp53P15975 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp53P15975 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp53P15975 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp53P15975 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp53P15975 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp53P15975 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp53P15975 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp53P15975 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms