Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd44P15379 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd44P15379 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd44P15379 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd44P15379 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd44P15379 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd44P15379 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd44P15379 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd44P15379 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd44P15379 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd44P15379 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd44P15379 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms