Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrphP15331 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrphP15331 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrphP15331 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PrphP15331 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrphP15331 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrphP15331 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrphP15331 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrphP15331 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrphP15331 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrphP15331 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrphP15331 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrphP15331 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrphP15331 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrphP15331 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrphP15331 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrphP15331 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrphP15331 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrphP15331 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrphP15331 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrphP15331 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrphP15331 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrphP15331 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrphP15331 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrphP15331 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrphP15331 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrphP15331 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrphP15331 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrphP15331 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrphP15331 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrphP15331 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrphP15331 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrphP15331 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrphP15331 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrphP15331 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PrphP15331 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrphP15331 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrphP15331 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrphP15331 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrphP15331 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PrphP15331 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrphP15331 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrphP15331 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrphP15331 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrphP15331 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrphP15331 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrphP15331 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrphP15331 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrphP15331 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrphP15331 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrphP15331 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrphP15331 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrphP15331 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrphP15331 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrphP15331 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrphP15331 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrphP15331 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrphP15331 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrphP15331 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrphP15331 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrphP15331 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrphP15331 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrphP15331 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrphP15331 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrphP15331 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrphP15331 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrphP15331 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrphP15331 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrphP15331 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrphP15331 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrphP15331 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrphP15331 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrphP15331 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrphP15331 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrphP15331 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrphP15331 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrphP15331 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrphP15331 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrphP15331 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrphP15331 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrphP15331 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrphP15331 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrphP15331 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrphP15331 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrphP15331 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrphP15331 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrphP15331 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrphP15331 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrphP15331 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrphP15331 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrphP15331 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrphP15331 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrphP15331 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrphP15331 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrphP15331 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrphP15331 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrphP15331 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrphP15331 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrphP15331 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrphP15331 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms