Protein–RNA interactions for Protein: P13541

Myh3, Myosin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh3P13541 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh3P13541 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh3P13541 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh3P13541 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh3P13541 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myh3P13541 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myh3P13541 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myh3P13541 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myh3P13541 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myh3P13541 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myh3P13541 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myh3P13541 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myh3P13541 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Myh3P13541 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Myh3P13541 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myh3P13541 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Myh3P13541 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myh3P13541 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myh3P13541 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myh3P13541 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Myh3P13541 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myh3P13541 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myh3P13541 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myh3P13541 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myh3P13541 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myh3P13541 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myh3P13541 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myh3P13541 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myh3P13541 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myh3P13541 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myh3P13541 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myh3P13541 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myh3P13541 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myh3P13541 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myh3P13541 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myh3P13541 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myh3P13541 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms