Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl1P12850 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl1P12850 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms