Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RaraP11416 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RaraP11416 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RaraP11416 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RaraP11416 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RaraP11416 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RaraP11416 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RaraP11416 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RaraP11416 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RaraP11416 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RaraP11416 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RaraP11416 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RaraP11416 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RaraP11416 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RaraP11416 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RaraP11416 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RaraP11416 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RaraP11416 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RaraP11416 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RaraP11416 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RaraP11416 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RaraP11416 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RaraP11416 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RaraP11416 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RaraP11416 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RaraP11416 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RaraP11416 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RaraP11416 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RaraP11416 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RaraP11416 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RaraP11416 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RaraP11416 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RaraP11416 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RaraP11416 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RaraP11416 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RaraP11416 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RaraP11416 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RaraP11416 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RaraP11416 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RaraP11416 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RaraP11416 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RaraP11416 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RaraP11416 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RaraP11416 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RaraP11416 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RaraP11416 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RaraP11416 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RaraP11416 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RaraP11416 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RaraP11416 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RaraP11416 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RaraP11416 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RaraP11416 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RaraP11416 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RaraP11416 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RaraP11416 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RaraP11416 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RaraP11416 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RaraP11416 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RaraP11416 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RaraP11416 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RaraP11416 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RaraP11416 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RaraP11416 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RaraP11416 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RaraP11416 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RaraP11416 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RaraP11416 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RaraP11416 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RaraP11416 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RaraP11416 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RaraP11416 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RaraP11416 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RaraP11416 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RaraP11416 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RaraP11416 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RaraP11416 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RaraP11416 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RaraP11416 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RaraP11416 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RaraP11416 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RaraP11416 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RaraP11416 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RaraP11416 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RaraP11416 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RaraP11416 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RaraP11416 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RaraP11416 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RaraP11416 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RaraP11416 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RaraP11416 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RaraP11416 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RaraP11416 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RaraP11416 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RaraP11416 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RaraP11416 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RaraP11416 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RaraP11416 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RaraP11416 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RaraP11416 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms