Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Col1a1P11087 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col1a1P11087 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col1a1P11087 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms