Protein–RNA interactions for Protein: P11033

Gzmd, Granzyme D, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmdP11033 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GzmdP11033 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GzmdP11033 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GzmdP11033 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GzmdP11033 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GzmdP11033 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GzmdP11033 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GzmdP11033 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GzmdP11033 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GzmdP11033 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GzmdP11033 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GzmdP11033 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GzmdP11033 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms