Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spp1P10923 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spp1P10923 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spp1P10923 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Spp1P10923 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spp1P10923 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spp1P10923 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spp1P10923 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spp1P10923 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spp1P10923 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spp1P10923 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Spp1P10923 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Spp1P10923 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spp1P10923 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms