Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hoxc6P10629 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms