Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP10400 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP10400 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP10400 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP10400 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PolP10400 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP10400 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP10400 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP10400 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP10400 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PolP10400 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PolP10400 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PolP10400 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PolP10400 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PolP10400 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PolP10400 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP10400 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP10400 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP10400 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP10400 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP10400 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP10400 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP10400 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP10400 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP10400 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP10400 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP10400 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP10400 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PolP10400 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP10400 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP10400 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP10400 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP10400 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP10400 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP10400 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP10400 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP10400 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PolP10400 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP10400 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP10400 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP10400 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP10400 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP10400 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP10400 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP10400 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP10400 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PolP10400 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP10400 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP10400 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP10400 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP10400 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP10400 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP10400 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP10400 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP10400 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP10400 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP10400 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP10400 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP10400 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP10400 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP10400 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP10400 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP10400 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP10400 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP10400 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP10400 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP10400 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP10400 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP10400 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP10400 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP10400 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP10400 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP10400 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PolP10400 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PolP10400 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PolP10400 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PolP10400 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PolP10400 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PolP10400 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PolP10400 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PolP10400 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PolP10400 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PolP10400 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PolP10400 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PolP10400 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PolP10400 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PolP10400 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PolP10400 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PolP10400 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PolP10400 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PolP10400 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PolP10400 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PolP10400 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PolP10400 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PolP10400 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PolP10400 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PolP10400 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PolP10400 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PolP10400 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PolP10400 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms