Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myod1P10085 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myod1P10085 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myod1P10085 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myod1P10085 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myod1P10085 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myod1P10085 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myod1P10085 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myod1P10085 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myod1P10085 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myod1P10085 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Myod1P10085 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms