Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Dnmt3cP0DOY1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnmt3cP0DOY1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnmt3cP0DOY1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dnmt3cP0DOY1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms