Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Hoxc9P09633 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxc9P09633 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxc9P09633 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxc9P09633 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxc9P09633 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxc9P09633 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hoxc9P09633 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hoxc9P09633 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hoxc9P09633 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hoxc9P09633 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hoxc9P09633 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hoxc9P09633 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hoxc9P09633 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hoxc9P09633 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hoxc9P09633 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hoxc9P09633 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hoxc9P09633 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hoxc9P09633 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hoxc9P09633 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms