Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna9P09235 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna9P09235 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms