Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxa1P09022 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa1P09022 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms