Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TtrP07309 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TtrP07309 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TtrP07309 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TtrP07309 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TtrP07309 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TtrP07309 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TtrP07309 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TtrP07309 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TtrP07309 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtrP07309 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtrP07309 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtrP07309 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtrP07309 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TtrP07309 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TtrP07309 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtrP07309 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtrP07309 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtrP07309 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtrP07309 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtrP07309 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TtrP07309 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtrP07309 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtrP07309 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtrP07309 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtrP07309 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtrP07309 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtrP07309 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TtrP07309 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtrP07309 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtrP07309 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtrP07309 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtrP07309 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtrP07309 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtrP07309 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtrP07309 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtrP07309 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtrP07309 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtrP07309 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TtrP07309 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtrP07309 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtrP07309 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtrP07309 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtrP07309 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtrP07309 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtrP07309 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtrP07309 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtrP07309 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtrP07309 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtrP07309 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtrP07309 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtrP07309 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtrP07309 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TtrP07309 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TtrP07309 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TtrP07309 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TtrP07309 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TtrP07309 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TtrP07309 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TtrP07309 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TtrP07309 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TtrP07309 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TtrP07309 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TtrP07309 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TtrP07309 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TtrP07309 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TtrP07309 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TtrP07309 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TtrP07309 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TtrP07309 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TtrP07309 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TtrP07309 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TtrP07309 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TtrP07309 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TtrP07309 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TtrP07309 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TtrP07309 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TtrP07309 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TtrP07309 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TtrP07309 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtrP07309 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtrP07309 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TtrP07309 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtrP07309 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtrP07309 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtrP07309 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtrP07309 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtrP07309 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtrP07309 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtrP07309 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtrP07309 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtrP07309 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtrP07309 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtrP07309 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtrP07309 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtrP07309 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtrP07309 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtrP07309 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtrP07309 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtrP07309 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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