Protein–RNA interactions for Protein: P06876

Myb, Transcriptional activator Myb, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MybP06876 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MybP06876 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MybP06876 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MybP06876 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MybP06876 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MybP06876 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MybP06876 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MybP06876 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MybP06876 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MybP06876 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MybP06876 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MybP06876 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MybP06876 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MybP06876 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MybP06876 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MybP06876 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MybP06876 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MybP06876 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MybP06876 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MybP06876 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MybP06876 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MybP06876 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MybP06876 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MybP06876 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MybP06876 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MybP06876 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MybP06876 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MybP06876 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MybP06876 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MybP06876 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MybP06876 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MybP06876 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MybP06876 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MybP06876 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MybP06876 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MybP06876 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MybP06876 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MybP06876 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MybP06876 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MybP06876 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MybP06876 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MybP06876 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MybP06876 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MybP06876 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MybP06876 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MybP06876 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MybP06876 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MybP06876 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MybP06876 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MybP06876 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MybP06876 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MybP06876 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MybP06876 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MybP06876 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MybP06876 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MybP06876 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MybP06876 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MybP06876 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MybP06876 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MybP06876 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MybP06876 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MybP06876 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MybP06876 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MybP06876 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MybP06876 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MybP06876 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MybP06876 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MybP06876 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MybP06876 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MybP06876 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MybP06876 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MybP06876 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MybP06876 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MybP06876 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MybP06876 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MybP06876 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MybP06876 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MybP06876 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MybP06876 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MybP06876 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MybP06876 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MybP06876 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MybP06876 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MybP06876 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MybP06876 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MybP06876 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MybP06876 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MybP06876 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MybP06876 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MybP06876 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MybP06876 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MybP06876 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MybP06876 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MybP06876 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MybP06876 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MybP06876 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MybP06876 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MybP06876 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MybP06876 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MybP06876 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms