Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxa7P02830 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxa7P02830 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms