Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01878 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01878 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01878 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01878 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01878 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01878 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01878 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01878 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01878 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01878 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01878 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01878 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01878 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01878 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01878 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01878 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01878 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01878 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01878 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01878 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01878 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01878 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01878 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01878 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01878 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01878 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01878 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01878 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01878 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01878 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01878 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01878 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01878 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01878 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01878 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
P01878 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
P01878 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01878 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01878 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01878 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01878 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01878 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01878 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01878 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01878 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
P01878 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01878 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01878 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P01878 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P01878 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01878 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01878 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01878 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01878 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01878 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01878 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01878 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01878 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01878 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01878 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01878 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01878 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01878 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01878 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
P01878 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01878 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
P01878 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01878 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01878 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01878 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01878 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01878 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01878 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01878 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01878 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01878 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01878 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01878 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01878 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01878 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01878 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01878 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01878 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01878 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01878 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01878 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01878 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01878 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01878 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01878 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01878 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01878 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
P01878 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01878 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
P01878 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
P01878 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01878 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01878 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01878 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms