Protein–RNA interactions for Protein: P01812

Ig heavy chain V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01812 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01812 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01812 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01812 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01812 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01812 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01812 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01812 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01812 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01812 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01812 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01812 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01812 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01812 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01812 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01812 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01812 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01812 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01812 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01812 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01812 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01812 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01812 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01812 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01812 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01812 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01812 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01812 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01812 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01812 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01812 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01812 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01812 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01812 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01812 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01812 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01812 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01812 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01812 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01812 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01812 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01812 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01812 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01812 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01812 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01812 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01812 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01812 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01812 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01812 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01812 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01812 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01812 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01812 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01812 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01812 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01812 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01812 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01812 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01812 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01812 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01812 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01812 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01812 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01812 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01812 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01812 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01812 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01812 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01812 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01812 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01812 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01812 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01812 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01812 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01812 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01812 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01812 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01812 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01812 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01812 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01812 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01812 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01812 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01812 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01812 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01812 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01812 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01812 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01812 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01812 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01812 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01812 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01812 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01812 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01812 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01812 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01812 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01812 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01812 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms