Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01747 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01747 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01747 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01747 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01747 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01747 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01747 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01747 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01747 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01747 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01747 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01747 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01747 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01747 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01747 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01747 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P01747 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01747 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01747 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01747 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01747 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01747 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01747 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01747 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01747 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01747 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01747 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01747 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01747 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01747 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01747 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01747 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01747 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01747 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01747 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01747 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01747 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01747 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01747 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01747 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01747 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01747 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01747 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01747 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01747 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01747 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01747 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01747 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01747 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01747 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01747 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01747 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01747 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01747 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01747 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01747 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01747 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01747 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01747 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01747 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01747 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01747 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01747 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01747 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01747 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01747 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01747 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01747 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01747 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01747 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01747 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01747 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01747 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01747 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01747 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01747 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01747 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01747 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01747 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01747 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01747 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01747 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01747 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01747 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01747 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01747 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01747 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01747 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01747 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01747 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01747 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01747 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01747 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01747 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01747 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01747 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01747 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01747 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01747 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms