Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01741 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01741 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01741 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01741 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01741 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01741 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01741 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01741 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01741 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01741 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01741 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01741 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01741 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01741 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01741 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01741 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01741 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01741 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01741 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01741 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01741 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01741 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01741 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01741 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01741 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01741 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01741 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01741 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01741 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01741 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01741 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01741 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01741 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01741 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01741 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01741 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01741 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01741 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01741 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01741 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01741 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01741 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01741 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01741 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01741 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01741 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01741 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01741 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01741 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01741 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01741 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01741 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01741 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01741 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01741 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01741 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01741 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01741 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01741 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01741 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01741 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01741 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01741 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01741 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01741 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01741 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01741 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01741 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01741 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01741 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01741 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01741 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01741 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01741 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01741 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01741 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01741 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01741 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01741 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01741 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01741 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01741 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01741 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01741 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01741 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01741 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01741 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01741 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01741 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01741 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01741 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01741 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01741 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01741 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01741 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01741 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01741 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01741 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01741 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms