Protein–RNA interactions for Protein: P01650

Ig kappa chain V-V region UPC 61, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01650 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01650 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01650 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01650 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01650 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01650 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01650 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01650 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01650 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01650 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01650 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
P01650 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
P01650 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01650 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01650 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01650 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01650 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01650 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01650 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01650 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01650 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01650 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
P01650 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01650 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01650 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01650 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01650 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01650 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01650 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01650 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01650 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01650 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01650 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01650 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01650 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01650 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01650 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01650 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01650 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01650 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
P01650 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01650 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01650 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01650 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01650 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01650 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01650 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
P01650 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01650 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01650 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01650 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01650 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01650 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01650 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01650 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01650 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01650 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01650 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01650 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01650 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
P01650 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
P01650 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01650 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01650 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01650 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01650 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01650 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01650 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01650 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01650 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01650 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01650 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
P01650 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01650 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01650 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01650 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
P01650 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01650 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01650 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01650 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
P01650 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01650 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
P01650 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01650 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01650 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01650 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01650 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01650 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01650 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01650 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
P01650 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01650 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01650 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01650 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01650 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01650 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01650 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01650 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01650 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01650 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms