Protein–RNA interactions for Protein: P00687

Amy1, Alpha-amylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amy1P00687 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amy1P00687 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amy1P00687 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amy1P00687 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amy1P00687 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amy1P00687 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amy1P00687 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amy1P00687 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amy1P00687 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amy1P00687 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amy1P00687 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amy1P00687 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amy1P00687 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amy1P00687 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amy1P00687 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amy1P00687 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Amy1P00687 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Amy1P00687 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Amy1P00687 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amy1P00687 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amy1P00687 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Amy1P00687 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.6 ms