Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp1O89090 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sp1O89090 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp1O89090 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp1O89090 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp1O89090 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp1O89090 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp1O89090 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp1O89090 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sp1O89090 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sp1O89090 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sp1O89090 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sp1O89090 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp1O89090 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp1O89090 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp1O89090 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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