Protein–RNA interactions for Protein: O88935

Syn1, Synapsin-1, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syn1O88935 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syn1O88935 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syn1O88935 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syn1O88935 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syn1O88935 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syn1O88935 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syn1O88935 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syn1O88935 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syn1O88935 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syn1O88935 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syn1O88935 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syn1O88935 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syn1O88935 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syn1O88935 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Syn1O88935 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syn1O88935 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syn1O88935 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syn1O88935 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms