Protein–RNA interactions for Protein: O88676

Mmp23, Matrix metalloproteinase-23, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp23O88676 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp23O88676 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp23O88676 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp23O88676 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp23O88676 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp23O88676 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp23O88676 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp23O88676 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp23O88676 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp23O88676 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp23O88676 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp23O88676 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp23O88676 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp23O88676 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp23O88676 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp23O88676 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp23O88676 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp23O88676 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp23O88676 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp23O88676 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp23O88676 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms