Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc6a20bO88575 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc6a20bO88575 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc6a20bO88575 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc6a20bO88575 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc6a20bO88575 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc6a20bO88575 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc6a20bO88575 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc6a20bO88575 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc6a20bO88575 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc6a20bO88575 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc6a20bO88575 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc6a20bO88575 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc6a20bO88575 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc6a20bO88575 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc6a20bO88575 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc6a20bO88575 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc6a20bO88575 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc6a20bO88575 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc6a20bO88575 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc6a20bO88575 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc6a20bO88575 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc6a20bO88575 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc6a20bO88575 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc6a20bO88575 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms