Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nme6O88425 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nme6O88425 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme6O88425 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme6O88425 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms