Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm10509O88255 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10509O88255 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10509O88255 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10509O88255 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10509O88255 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10509O88255 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm10509O88255 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10509O88255 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10509O88255 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10509O88255 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10509O88255 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm10509O88255 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10509O88255 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10509O88255 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10509O88255 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10509O88255 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10509O88255 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10509O88255 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10509O88255 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10509O88255 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10509O88255 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10509O88255 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10509O88255 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10509O88255 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10509O88255 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10509O88255 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10509O88255 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10509O88255 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10509O88255 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10509O88255 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10509O88255 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10509O88255 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10509O88255 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10509O88255 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10509O88255 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10509O88255 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10509O88255 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm10509O88255 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm10509O88255 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm10509O88255 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm10509O88255 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10509O88255 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10509O88255 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10509O88255 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10509O88255 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10509O88255 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10509O88255 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10509O88255 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10509O88255 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10509O88255 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10509O88255 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm10509O88255 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10509O88255 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10509O88255 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10509O88255 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10509O88255 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10509O88255 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10509O88255 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10509O88255 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10509O88255 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10509O88255 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10509O88255 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10509O88255 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm10509O88255 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10509O88255 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10509O88255 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10509O88255 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10509O88255 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10509O88255 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10509O88255 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10509O88255 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10509O88255 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10509O88255 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms